Un grupo de investigadores de Google DeepMind y del Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL) dieron a conocer el pasado jueves una base de datos de libre acceso, en la cual se incluye información de 20 mil proteínas manifestadas por el genoma humano, así como otros 350 mil datos procedentes de 20 organismos utilizados para la investigación, tales como bacterias y ratones.
Los científicos realizaron su anuncio en la revista "Nature" con lo cual pusieron al alcance de la población lo que consideraron la mayor base de datos de proteínas, mismas que forman las estructuras de la vida; esta información, aseguraron los especialistas en el artículo, “cambiará fundamentalmente la investigación en biología” que se realiza en el presente.
La base de datos fue obtenida gracias a un programa de aprendizaje automático capaz de predecir con precisión la forma de una proteína a partir de su secuencia de aminoácidos, se señala en el estudio, ya que cada célula de un organismo viviente ejecuta su función con la ayuda de proteínas que a su vez transmiten de forma permanente instrucciones para así mantener en buena salud a la célula y combatir las infecciones.
¿Para qué sirve entender el funcionamiento de las proteínas?
De acuerdo con lo dado a conocer por los especialistas, la comprensión del funcionamiento de las proteínas, a través de la forma que adopten al interior de las células, es un verdadero desafío y a diferencia del genoma (la secuencia de los genes que codifican la vida celular), el proteoma humano cambia de manera constante en respuesta a instrucciones genéticas y estímulos exteriores.
Por ello la investigación científica se han enfocado en determinar a través de experimentos esta función precisa, pero tras 50 años de estudios, sólo se conoce hasta ahora 17 por ciento de los aminoácidos, o componentes del proteoma humano. Hay que recordar que el programa AlphaFold se entrenó con base en 170 mil estructuras conocidas de proteínas y luego predijo la forma de 58 por ciento de todas las del proteoma humano: “Lo que tomaba meses y años en cumplirse fue realizado en un fin de semana por AlphaFold”, declaró John McGeehan, director del Centro de Innovación de Enzimas de la Universidad de Portsmouth.
Se aseguró además que las aplicaciones potenciales de estos datos van de la investigación sobre enfermedades genéticas a la ingeniería de cosechas resistentes a la sequía y de acuerdo con Paul Nurse, premio Nobel de Medicina y director del Instituto Francis Crick, este avance es “un gran paso para la innovación en biología”. Además que la capacidad para predecir con un programa informático la forma de una proteína, a partir de su secuencia de ácidos aminados, ya se aplica en algunos sectores de la investigación, recordaron los especialistas.